Прошло три года со времени Манги и сериала. Итачи выжил после сражения с Саске и прошёл курс реабилитации, оправившись от ран он вернулся в Акацуки и увидел следующую картину…
На Акацки напали коноховцы, суновцы и кириевцы, и вернули чудом выжившим джинчурики их демонов. Через некоторое время В Акацки пришли так же загадочно выжившие Сасори, Дейдара, Какудзу, собранный по частям Хидан. В это же время в Конохе объявился Четвёртый Хокаге, и начал тренировки с чакрой джинчурики, все джинчурики вошли в состав Конохи (на время) и начали тренировки. Почти все джинчурики остались в Конохе, однако есть такие, кто отказался от тренировок, некоторые джинчурики, такие как Хачиби, Санби и Гаара вернулись в свои селения... Хачиби просто хотел свободы, Санби является Амекаге, а Гаара - Казекаге, поэтому они отказались от тренировок с четвёртым
Так как кому-то нужно было возглавить Акацуки - это сделал Итачи, он начал активные поиски своего брата и вскоре нашёл его, он предложил Саске стать одним из организации, чтобы вместе с ним начать снова ловить Джинчурики... Однако случилось следующее в это самое время Сасори и Дейдра поймали пятихвостого Джинчурики и привели к Итачи, который входе разговора понял, что это его младшая сестра, Итачи не стал брать у неё демона, а оставил его внутри девушки, он предложил ей встать в ряды Акацуки и начал обучать её вместе с братом Саске Тем же временем, вновь оживший Орочимару строит планы захвата Джинчурики, чтобы уничтожить Коноху и Акацуки... Он собирает новую команду звука и начинает разведку... Для начала он реашает столкнуть две деревни друг с другом, он убивает послов Конохи и Суны, когда те одновременно приезжают в селения Коноховец в Суну, Суновец в Коноху, начинается ожесточённая конффронтация, но Гаара не спешит развязывать военные действия......Наруто так же стал Хокаге после того как Тсунаде оставила этот пост. Наруто как и Гаара не собирается развязывать войну со своим лучшим другом. (Пейн  находица в состоянии стазиса, короче недееспособен, пока.)Саске охотно согласился на предложение Итачи, и вместе со своей командой вошёл в организацию. ЧЕтвёртый помимо тренировок желает остановить организацию Акацки...чтобы уберечь своего сына. Новая команда Орочимару имеет тот же состав только вместо Земной проклятой печати Орочимару поставил им Небесную (как у Саске и Анко если кто не знает)...